В далеком 1584 году русским правительством было решено назвать нынешнюю столицу Поморья, а тогда еще только «деревянную крепостицу» — Новохолмогорском, однако название это не прижилось: жители устно и в челобитных упорно называли свое поселение «Архангельским городом» по наименованию монастыря.
В течение последующих трех лет на берегу реки были возведены для приема своих и иноземных купцов гостиные дворы — русский и немецкий, а также важня (амбар для взвешивания товаров). Еще раньше в городе была построена таможенная изба. Все это создавало необходимые условия для нормального ведения торговых операций и контроля за ними со стороны властей.
Для полного городского ансамбля недоставало лишь посада — так называли в старину располагавшуюся за крепостной стеной торгово-ремесленную часть города. Посад был создан в 1587 году. В него насильно переселили 130 семей из окрестных сел и посадов. Причем большинство «перевезенцев» составляли крестьяне-пахари, не имевшие элементарных навыков коммерческой деятельности. Занимались они розничной торговлей продовольственными товарами, извозом и ремеслом. Для устройства дворов на новом месте и обзаведения хозяйством первые посадские люди Архангельска на пять лет освобождались от уплаты государственных налогов.
Так было завершено создание нового русского города и порта в дельте Северной Двины. Устройство крепости и посада определило как границы, так и территорию Архангельска.
Одновременно с образованием посада в Архангельске открылся морской торговый порт, и сюда была перенесена вся морская торговля с иностранцами из Корельского, или Никольского, устья Северной Двины. Архангельск стал единственной гаванью Русского Севера, куда иностранцы могли привозить свои товары и где им разрешалось закупать товары, доставленные из внутренних областей страны.
У гостиных дворов стояло две церкви, а ниже, в торговых рядах, 70 лавок архангельских и холмогорских купцов. Со всех служб и промыслов Архангельск вносил в казну 210 рублей городового сбора, что составляло около 3000 рублей на деньги конца XIX века. Это помимо экстренных, пятинных денег, которые также были значительны.
16 мая 1667 года в Архангельске произошел сильный пожар, в результате которого деревянные Гостиные дворы сгорели.